Balstoties uz esošajiem muzeja resursiem, kā arī veicot to nepārtrauktu papildināšanu un pilnveidošanu, DU muzeja misija ir apzināt, saglabāt, pētīt un popularizēt liecības (dokumentus, fotogrāfijas, atmiņas un lietiskos priekšmetus) par universitātes attīstību no 20. gs. sākuma līdz mūsdienām, lai informētu, ieinteresētu un izglītotu skolēnus, studentus un plašākus sabiedrības slāņus par augstskolas vēsturi un ieguldījumu izglītības un zinātnes attīstībā reģionālā, valstiskā un starptautiskā līmenī.

DU Muzeja krājumā ietilpst gadu gaitā uzkrātās lietiskās, rakstītās, foto un audio liecības par augstskolas attīstību un svarīgākajām ar to saistītajām norisēm, augstskolas darbiniekiem un absolventiem.